Три найпоширеніші типи мембран для перенесення, які використовуються для виявлення перенесення білків і нуклеїнових кислот, це нітроцелюлозні мембрани, мембрани з полівініліденфториду (PVDF) і нейлонові мембрани. Нітроцелюлозні мембрани є широко використовуваною матрицею в білковому блоті через їх високу афінність зв’язування з білками та сумісність з різними методами виявлення. Здатність нітроцелюлозних мембран до зв’язування білка становить 80-100 мкг/см², а іммобілізація білка в основному відбувається через гідрофобні взаємодії. Нітроцелюлозні мембрани є крихкими та крихкими, що обмежує їх використання для видалення та повторного маркування.
Мембрани з полівініліденфториду (PVDF) мають високу афінність зв’язування як з білками, так і з нуклеїновими кислотами. ПВДФ-мембрани є високогідрофобними, і їх необхідно попередньо -змочити метанолом або етанолом перед зануренням у буфер для перенесення. Здатність мембран ПВДФ до зв’язування білків становить 170-200 мкг/см². Порівняно з нітроцелюлозою мембрани PVDF є менш крихкими та крихкими, мають кращу механічну міцність і хімічну стабільність і підходять для експериментів вестерн-блоттингу, що вимагають етапів видалення та повторного маркування. Завдяки своїй гідрофобності мембрани PVDF є кращим вибором для гідрофобних білків.
Нейлонові мембрани зв’язують білки та нуклеїнові кислоти через іонні, електростатичні та гідрофобні взаємодії. Здатність зв'язувати білки нейлонових мембран може досягати 480 мкг/см². Нейлонові мембрани демонструють високу міцність, пропонуючи переваги в експериментах вестерн-блотінгу, які вимагають процедур видалення та повторного маркування. Значним недоліком використання нейлонових мембран для промокання є можливість не-специфічного зв’язування з аніонами.